Integrado num contexto escolar, o Serviço de Psicopedagogia (SPP) do CSJB está particularmente direccionado para o acompanhamento de casos relacionados com dificuldades nos domínios da aprendizagem, educação e desenvolvimento e privilegia naturalmente uma avaliação e intervenção sistémica que valoriza muito o trabalho em equipa com os pais, professores e outros agentes educativos.

Estando inserido num Colégio Católico que se rege pela Pedagogia Inaciana, o SPP tem também como objectivo contribuir para o desenvolvimento pessoal, moral e espiritual dos alunos, utilizando os passos da experiência, reflexão, acção e avaliação.